早二叠世晚期发生世界范围海退，至晚二叠世长兴期，世界各大陆海水退居大洋，仅在特提斯边缘陆棚区保留海水。关于海退与海相生物大绝灭的关系，许多人作过有说服力的统计和论证，证明科一级分异度的下降与陆表海面积缩小呈正相关。海退使大量陆表海消失，只剩下陆缘海，使许多底栖生物的生境消失；或使陆棚海区分割并面积缩小，使生物群过分拥挤，生存竞争加剧而导致某些狭温生物的绝灭。近年研究揭示出，当晚二叠世晚期（长兴期）全世界发生海退，浅海面积进一步减少时，而华南海在长兴期早期和中期却是一个海侵过程，直到长兴晚期才发生海退，但海水并未完全退走，因此，二叠系—三叠系连续剖面在华南最发育。长兴晚期的海退终结于二叠系—三叠系界线之下几十至百厘米处的重要生物衰亡线上，接着又开始一个跨越两系界线新的海侵过程。在二叠系—三叠系界线下海侵—海退—海侵，即海平面的高速升降波动，导致了生境的频繁变化，促使了许多古生代型高度特化的窄生境性生物的集群绝灭。

华南二叠系—三叠系界线地层研究越来越深入,在界线划分、沉积环境、生物绝灭等方面，都对传统的认识有重要修改。过去一般认为二叠纪末为海退结束，新的海侵从三叠纪开始，生物绝灭主要发生在界线上。现在越来越多的资料证明：①二叠纪末期的海退结束在界线之下几十厘米或数米处；新的海侵发生在界线之下二叠系内。这就是为什么华南两系之间在大面积连续沉积的原因。②二叠纪生物绝灭主要发生在二叠纪晚期海退过程中，海退结束的界线是一条重要的生物绝灭或衰亡线。